第一百八十三章 老裘，你的病有救啦！(5.4K)

bsp; 如果是培养皿培育出的菌株，检测或者对比的难度往往都不高。

    但对象若是自然界富集的样本，操作起来就比较麻烦了。

    徐云所说的16s相似度检测，指的是核糖体小亚基的rna组分检测。

    也就是16srrna。

    这部分长度大约1500nt，不同物种略有差异，算是目前主流的九大新物检测步骤之一。

    五分钟后。

    裘生抬起头，对徐云道：

    “老徐，准备好了，引物你觉得用啥？”

    徐云想了想，很快道：

    “1492r吧。”

    “好嘞！”

    半个小时后。

    裘生抬起头，打了个响指：

    “搞定，扩出来了，blast的密匙你有吧？”

    徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮，随后走到操作台边，噼里啪啦的输了一大串密匙。

    做过新种检测的同学应该都知道。

    16s相似度检测的界限其实有些模糊，因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。

    比如有的是97%，有的是99%。

    只是在通常情况下。

    相似度超过97%的，就可以认为是一个物种。

    相似度低于97%的，就可以认为是不同物种，进行下一阶段检测。

    不过就是这样一种不太精细的检测手段，却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：

    大部分样本在经过检测之后，都会发现相似度在99.99%以上，与其他某某微生物是同一物种。

    总而言之。

    这项技术在定属方面还是靠谱的。

    又过了一会儿。

    裘生一脸惊喜的抬起头，声音骤然拔高了几分：

    “老徐，相似度46.9%，46.9%！！”

    “毫无疑问，这是一类新物！”

    徐云认真的看了他一眼，确认道：

    “只有一种新物吗？”

    “没错，只有一种！”

    徐云若有所思的点点头，又道：

    “那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”

    众所周知。

    新物鉴定一般都有九个流程：

    1、16s相似度。

    2、形态学观察。

    比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等，还包括最适生长条件的确定。

    3、磷脂脂肪酸鉴定，这个具有属特异性。

    4、呼吸醌，也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种，这个有种特异性。

    5、分子杂交，也就是测定基因组序列，草图就行，然后跟近源物种去比较。

    相似度超过70%是一个种，低于70%是不同物种。

    6、碳源利用情况，看一下能利用哪些碳源，一共有95种碳源的测试。

    7、api试剂盒鉴定，生理生化鉴定的一方面。

    8、gc含量。

    9、革兰氏染色。

    大概经过这些方面的检查，就可以确定是不是新种了。（注：不知道这样写的比较详细大家愿不愿意看？这种详细流程应该没有其他书写过，找人问其实很麻烦的，要是还被嫌水下次我就不写了）

    其中第五个流程，也就是分子杂交这次可以直接忽略——毕竟第一部测出来的46.9%实在是差距太明显了。

    考虑到时间问题，徐云将几个步骤逐一分工，由几位工具人...咳咳，课题组成员同步进行。

    五个小时后。

    一道最终报告出炉了。

    “节丛孢属的一类全新微生物，1000倍油镜下可观察到形态，体外具备大量假丝。”

    “这种假丝可以分离，与目标结合完成某种化合反应，这是...秃头攻击？”

    “一片青苔中可以高密度富集8000单位的极少量新物，特性上与嗜酸乳杆菌有一定类似...嗯？”

    随后看着其中的一栏报告，徐云有些疑惑的抬起头，对裘生问道：

    “老裘，新物对食物残渣的净化效果最为明显？”

    裘生点了点头，指着不远处的一个培养皿道：

    “经过我们的初步检测，这种新型微生物可以有效遏制残渣中氨气、有机酸和硫化物的生成。”

    “并且对奈瑟氏菌和厌氧链球菌之类的细菌，有着极强的杀伤力。”

    徐云微微一愣：

    “奈瑟氏菌和厌氧链球菌？”

    不过很快，他便反应了过来：

    这两种西军，都是人体唾液和牙龈的标准分泌物之一：

    每一毫升的普通唾液里可以寻找出奈瑟氏菌8000万个，在每一克牙龈分泌物中更是可以寻找出10亿个厌氧链球菌。

    在食堂里吐出骨头啦、吐出西红柿皮啦、吐出半截蛆虫时沾染上这些细菌，最后流入下水管道是很正常的事情。

    接着徐云指着报告，对裘生说道：

    “老裘，新种只对食物残渣和唾液细菌有效吗？”

    裘生沉吟片刻，答道：

    “准确的说，新种对于其他一些臭味源也有一定的扼制作用，但效果都远不如食物残渣和唾液细菌。”

    徐云疑惑的看了他一眼，问道：

    “其他臭味源，都有哪些？”

    裘生立时掰持起了手指：

    “厕所里的小八小汉堡，还有小李找他室友要来的一小片两个礼拜没洗的手袜子，还有.......”

    “停停停，打住打住！”

    徐云额头顿时冒出了一股黑线，连忙止住了裘生的描述。

    随后他强迫自己平复了一番心情，继续道：

    “得，你干脆直接报数据吧。”

    裘生很是恶趣味的一笑，又从桌上拿起了另一份报告：

    “比起其他臭味源，新种对于食物残渣和唾液细菌的效果简直可以用逆天来形容。”

    “比如我们富集到的一个新种植株，生物效能才8000单位，小的可怜。”

    “可它将一块0.3立方厘米大小的食物残渣彻底净化干净的时间，前后也不过二十分钟罢了。”

    说着说着，裘生不由在徐云面前比划了个8的手势：

    “这才8000单位啊，你看现在青霉素的单位，哪个不是百万级起步？”

    “老徐，你知道这意味着什么吗？”

    徐云沉默片刻，随后眉头一掀：

    “代表着......你的口臭有救了？”

    ........